据美国信息科学研究所 (ISI) 基本科学指数 (Essential Science Indicator) 数据库2006年9月1日最新数据显示，1996年1月1日至2006年6月30日论文数排在前10名的中国高等院校中，大陆有6所，香港、台湾地区各2所；引用次数排在前10名的中国高等院校中，大陆有4所，香港、台湾3所。具体排序为：
SCI论文数的排序是：
| 序号 |
大 学 名 称 |
论文数量 |
|
1 |
台湾大学 | 22623 |
|
2 |
清华大学 | 19230 |
|
3 |
北京大学 | 16702 |
|
4 |
香港大学 | 16128 |
|
5 |
浙江大学 | 14335 |
|
6 |
香港中文大学 | 14052 |
|
7 |
南京大学 | 13439 |
|
8 |
台湾成功大学 | 12374 |
|
9 |
中国科学技术大学 | 11996 |
|
10 |
复旦大学 | 9926 |
SCI论文引用次数的排序是：
| 序号 |
大 学 名 称 |
论文数量 |
|
1 |
台湾大学 | 138819 |
|
2 |
香港大学 | 119736 |
|
3 |
香港中文大学 | 100119 |
|
4 |
北京大学 | 76336 |
|
5 |
香港科技大学 | 66104 |
|
6 |
台湾成功大学 | 60292 |
|
7 |
清华大学 | 58567 |
|
8 |
中国科学技术大学 | 56343 |
|
9 |
南京大学 | 55613 |
|
10 |
台湾清华大学 | 45976 |
来源：南京大学科技处《科技信息》
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