根据国家自然科学基金委员会与台湾财团法人李国鼎科技发展基金会达成的共识，两组织向两岸科研人员征集了地震科学领域合作研究申请。通过双方评审系统分别进行的同行评议、申请人答辩，以及协调等程序，最终决定对以下4个项目进行为期3年的联合资助（执行期限2009年1月—2011年12月）。
| 序号 | 科学部 编号 |
申请 代码 |
项目名称 | 申请人 | 依托单位 | 合作人 | 合作单位 | 建议资助金额 |
| 1 | 40810202 | D0211 | 汶川地震三维发震构造、现今运动状态和区域活动断层发震危险性综合评价 | 徐锡伟 | 中国地震局地质研究所 | 陈文山 | 台湾大学 | 220万 |
| 2 | 40810204 | D0402 | 2008汶川地震与1999集集地震震源过程、强地面运动及灾害效应比较研究 | 陈晓非 | 北京大学 | 马国凤 | 中央大学 | 126万 |
| 3 | 40810199 | D0402 | 汶川地震余震高精度水平位置及深度确定 | 倪四道 | 中国科学技术大学 | 赵 里 | 中研院地科所 | 50万 |
| 4 | 40810201 | D0402 | 2008年汶川Ms8.0级地震的地震活动性和深部构造环境研究 | 王椿镛 | 中国地震局地球物理研究所 | 黄柏寿 | 中研院地科所 | 120万 |
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